冷却塔为多生物体的生长和培养提供了理想的环境，非使用期间（冬季停留）加剧了这个问题，尽管一致的杀菌剂计划可以降低风险，但最好的做法是每年冷却塔至少两次，通常情况下，这种维护将在冷却季节开始时和秋季停机后的初始启动之前进行。
水冷冷水机在使用六个月的时候，要清洗冷水机的冷凝器以及水管管道。此外，要清洗冷却塔，正确的清洗方法可以按照以下步骤进行：
1、把冷却塔里面的沉积物、水垢、淤泥，以及长的青苔等清理干净，然后用清洗水枪清洗水塔的风扇、洒水器、填料、塔盘、出水槽和出水过滤网。
2、以上的各个部件清洗干净以后，启动循环水泵，在冷却塔中放入清洗剂和杀菌灭藻剂，把水的PH值控制在5.5～6.0之间，去除设备管道中的锈垢以及藻类。
3、把冷却塔清洗干净后，关闭上排污阀，重新打开补水阀，给冷却塔加满水。同时打开冷却塔的连通阀，将连通塔的水位调整平衡，以免发生溢水现象。
用户所处行业不同，水冷冷水机的出水温度也不一样，有了冷却塔，才能不断的带走水冷冷水机出来的水中的热量，如果冷却塔的散热效果不好，那么冷水机制冷效果肯定大打折扣。
闭式冷却塔
1、被冷却介质在密闭的管道内流动不与外界空气相接触，热量通过换热器管壁与外部的空气、喷淋水等进行热质换热，最终实现冷却介质降温的设备。所以被冷却介质不会被污 染、蒸发、浓缩，无须补水加药，因而保障了相联设备的使用性能和寿命，日常管理也很方便。
2、无须经常停机保养维护，运行稳定安全、可减低相联设备故障率，适合需要连续运转的系统。
3、被冷却介质因无阳光照射且不与空气接触，所以不会产生藻类和盐类结晶，“无须除藻、除盐”，从而保障系统高性能运行。
4、可以进行干式运行，不会滋生各类病菌，所以特别适用于有空气净化需求的场合，也经常应用于缺水干燥的地区。
5、当流体为挥发性或毒性、刺激性溶液时，使用密闭式循环系统，不会污染环境，所以广泛适用于对流体有严格要求的系统。
6、被冷却介质在密闭的管道内流动，被冷却介质一般为软化水，系统管道以及被冷却设备换热器内不会结垢，被冷却设备运行效率高，整个系统运行节能。
清洗后的漂洗
此次水冲洗是为了冲洗掉清洗时残留的清洗液以及清洗掉的杂质，冲洗是要不断开起导淋以使沉积在短管内的杂质、残液冲洗掉。冲洗是不断测试PH值，浊度，当PH值、浊度趋于平缓时结束冲洗。