布袋除尘器的阻力在很大程度上取决于过滤风速，除尘器结构、清洁滤袋、粉尘层的阻力都随过滤风速的提高而增加。一台脉冲袋式除尘器不管用什么样的滤料，其净过滤风速都不能超过1m/min，对微细粉尘层，由于粉尘粒子相互搭接细密，过滤风速需要更低，否则除尘器的运行阻力会增加。
在相同处理风量的条件下，气流上升速度取得大，说明在的袋室空间内除尘布袋与布袋之间的间距更小，除尘布袋布置更紧凑，除尘器的外形尺寸更小，但气流上升速度过大，除尘器的运行阻力也会相应增大。通常情况下，气流上升速度控制在1m/s左右更能发挥除尘器的使用性能。
布袋除尘器在设计时即使理论过滤风速和其他风速取得都很合理，但如果气流均布措施不到位，每个袋室的实际处理风量就会有高有低;即便在一个袋室内，如果气流均布措施不到位，每条布袋的实际过滤风速也会不同。所以，在除尘器的进风口处需要有气体导流板和均风板，需要调节进风支阀的开度以平衡各个袋室的风量，在灰斗内需要设置均风板来分布单个袋室的风量。
布袋除尘器的阻力一般可以通过清灰机构自动保持在设计时者所预定的数值。实际运行的布袋除尘器的阻力大多在500-2000pa的范围内。
布袋除尘器的阻力应当是兼顾除尘器设备费，运行费，除尘器滤袋使用寿命和除尘率等因素的结果。但是，要推算布袋除尘器的阻力是不容易的，因为它的阻力除了与过滤速度，粉尘负荷，清洁织物的透气度等比较容易查明的情况有关外，还与织物的表面状况，粉尘粒子的特性，气体的温湿度，除尘器的结构以及清灰方法有关。所以，通常多根据用类似的织物处理类似的气体与粉尘所阳得的实际经验来确定布袋除尘器的运行阻力。