无菌实验室也叫无菌试验室主要用于微生物学、生物医学、生物化学、动物实验、基因重组以及生物制品等研究使用的实验室，统称洁净实验室-生物实验室。
无菌实验室由准备室、洗涤室、室、无菌室、恒温培养室和普通实验室六部分组成。这些房间的共同特点是地板和墙壁的质地光滑坚硬，仪器和设备的陈设简洁，便于打扫卫生。
须将通向外界的管路、门窗和通风道四周的空隙完全充填，所有窗户、通风口和风机开口均应装上防护网。
无菌实验室的高度应能满足工艺、卫生要求，以及设备安装、维护、保养的需要。
供试品表面，如为安瓿先用砂轮划痕后用2%碘酒棉球擦拭，再用75%乙醇棉球擦拭、待干，也可以用液浸泡。
注射器如需回抽时，应对着火焰吸入无菌空气。
在无菌操作中切勿大幅度或快速动作、拖行，以免搅动空气中尘埃微粒。
所用的器材如培养基、稀释剂配制后经湿热121℃30分钟，吸管培养皿等均应洗涤，干燥，包扎后经干热160℃2小时才能使用。
空气调节系统必须可靠运行，采用先进技术，合理利用和节约能源与资源，保证环境的质量和，为实验人员提供所需要的温度和湿度，保障生物实验在的条件下进行，以确保实验结果得准确性。同时它还必须控制实验室的洁净度，对新风进行过滤，使实验室达到一定的净化要求。其中排风系统是重点，对于保证实验室相对负压环境和有效过滤室内污染排风起着重要的作用。