无菌室也称接种室，是系统接种、纯化菌种等无菌操作的专用实验室。在微生物工作中，菌种的接种移植是一项主要操作，这项操作的特点就是要保证菌种纯种，防止杂菌的污染。在一般环境的空气中，由于存在许多尘埃和杂菌，很易造成污染，对接种工作干扰很大。
无菌实验室建设和装修的主要组成部分
1、密闭良好的围房构建。
2、易净洁卫生的地坪处理。
3、优质的空气调节与循环净化过滤系统。
4、灵敏的洁净检测系统与控制系统。
5、设计合理的气压力隔离系统。
操作人员用肥皂洗手后进入缓冲间换拖鞋，用75%乙醇棉球擦手，穿戴工作衣帽、口罩。将所需物品剥去牛皮纸及外包装，从传递窗移入操作间，再用0.1%苯扎溴铵溶液泡手后进入操作间，在乙醇(或煤气灯)火焰区(火焰高度3-5cm)操作。
工作人员应注意自身之，须穿戴实验衣及手套后才进行实验。对于来自人类或是病毒感染之细胞株应特别小心操作，并选择适当等级之无菌操作台(至少ClassII)。操作过程中，应避免引起气溶胶类物质的产生，小心毒性药品，例如DMSO及TPA等，并避免尖锐针头之伤害等。