无菌室也称接种室，是系统接种、纯化菌种等无菌操作的专用实验室。在微生物工作中，菌种的接种移植是一项主要操作，这项操作的特点就是要保证菌种纯种，防止杂菌的污染。在一般环境的空气中，由于存在许多尘埃和杂菌，很易造成污染，对接种工作干扰很大。
无菌实验室墙壁与门窗
1、无菌实验室的墙壁应采用、不吸水、不渗水、防霉、平滑、易清洗的浅色材料构筑，用此材料装修高度应直至屋顶。
2、所有门窗结构应采用防锈、防潮、易清洗的密封框架。
操作者勿用嘴直接吸吹吸管，防止致病菌感染操作人员及口中的杂菌污染供试品。
供试品表面，如为安瓿先用砂轮划痕后用2%碘酒棉球擦拭，再用75%乙醇棉球擦拭、待干，也可以用液浸泡。
注射器如需回抽时，应对着火焰吸入无菌空气。
无菌操作工作区域应保持清洁及宽敞，必要物品，例如试管架、吸管吸取器或吸管盒等可以暂时放置，其它实验用品用完即应移出，以利于气流之流通。实验用品以70%的酒精擦拭后才带入无菌操作台内。实验操作应在抬面之中央无菌区域，勿在边缘的非无菌区域操作。