无菌工作区有用无菌操作台，没有的话也可以用洁净工作台代替。需要放置在离门远的地方。
无菌实验室设计的地面应使用、不渗水、不吸水、防滑、无裂隙且易于清洗的建筑材料铺砌(如耐酸砖、水磨石、混凝土等)，地面应有适当坡度(以1.0~1.5%为宜)。
无菌实验室屋顶与天花板
1、屋顶和天花板应选用不吸水、表面光洁、、防霉、耐腐蚀、易清洁的浅色材料覆涂。
2、食品及食品接触面暴露的上方不应设有蒸气、水、电气等辅助管道，以防止灰尘或冷凝水等落入。
无菌实验室空气处理净化设施
1、无菌实验室必须安装有效的通风设备，其空气流向应从清洁区域流向非清洁区域，采用机械通风时，换气量应大于3次/小时。
2、无菌实验室温度应控制在15~27℃之间，湿度以控制在50%以下为宜。
3、无菌实验室入口处应分别设有人员和物料的净化设施。
业内通行的验收标准为100级洁净区平板杂菌数平均不得超过1个菌落，10000级洁净室平均不得超过3个菌落，在通行标准之外，还应该定期保养与维护。只有建设时合理的选材指标，合适净化等级和长期管理与维护，才能使无菌实验室发挥其应有的作用。