准备室
准备室用于配制培养基和样品处理等。室内设有试剂柜、存放器具或材料的专柜、实验台、电炉、冰箱和上下水道、电源等。
洗涤室用于洗刷器皿等。由于使用过的器皿已被微生物污染，有时还会存在病原微生物。因此，在条件允许的情况下，应设置洗涤室。室内应备有加热器、蒸锅，洗刷器皿用的盆、桶等，还应有各种瓶刷、去污粉、肥皂、洗衣粉等。
无菌工作区有用无菌操作台，没有的话也可以用洁净工作台代替。需要放置在离门远的地方。
无菌实验室设计的地面应使用、不渗水、不吸水、防滑、无裂隙且易于清洗的建筑材料铺砌(如耐酸砖、水磨石、混凝土等)，地面应有适当坡度(以1.0~1.5%为宜)。
无菌实验室墙壁与门窗
1、无菌实验室的墙壁应采用、不吸水、不渗水、防霉、平滑、易清洗的浅色材料构筑，用此材料装修高度应直至屋顶。
2、所有门窗结构应采用防锈、防潮、易清洗的密封框架。
在无菌操作中切勿大幅度或快速动作、拖行，以免搅动空气中尘埃微粒。
所用的器材如培养基、稀释剂配制后经湿热121℃30分钟，吸管培养皿等均应洗涤，干燥，包扎后经干热160℃2小时才能使用。