水箱自洁器是外置式的水箱自洁器，臭氧溶于水后会发生两种反应：一种是直接氧化，反应速度慢，选择性高，易于等芳香族化合物及胺等反应。另一种是臭氧分解产生羟基自由基从而引发的链反应，此反应还会产生十分活泼的、具有强氧化能力的单原子氧，可瞬时分解水中有机物质、和微生物。