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简单来说，排污许可证就像驾照，有驾照才能开车上路，但是开车上路仍然要遵守相应的交通规则。
而排污许可证就是，有排污许可证才能排放污染物，但是有排污许可证之后也还是要按规定排放污染物，不能超标超量，不能乱排，不能偷排。“水质达标”也是其中要求之一。
当然实际排污许可证的管理功能远比驾照强得多。例如，每个企业领到的排污许可证上都规定了这个企业的具体排放要求，可以理解为为每个企业量身定制了一套交通规则。更多的环境管理要求及功能就不展开了。有兴趣可以搜一下《控制污染物排放许可制实施方案》《排污许可管理办法（试行）》。
“未取得排污许可证排放污染物，被责令停止排污，拒不执行”，是现行环保法四种可以予以行政拘留的情形之一。不过这个案子里面，孙某某撕毁封条本身就可能构成妨害社会管理秩序，可以移送行政拘留了。