冬虫夏草的采挖期，准确的预计方法主要为依据当时和往年同期天气冷暖对比情况。在采挖时间采挖，不但虫体充实饱满、肥壮，草头短，且易于发现和采挖。采量、质量、药效相比之下都要高。如果过早采挖，多数草头还末出土，不易寻找和采挖，过晚采挖则藏虫草干枯，虫体空心或腐烂。通常的采挖时间从立夏（5月5日）到夏至（6月21日），时间太早则未长出地面，时间太晚则会长成空心的虫草，或有寄生虫啃食。在海拔3200-5000米之间的山上，海拔太低没有虫草菌类生长，海拔太高没有一切生物生长；其中，山坡的背阴面（北侧）虫草数量较多，阳面（南侧）数量较少，但阳面的个头一般较大。半山腰挖虫草的人，要弯腰，细细寻找。
挖冬虫夏草，一般用铁锹连草皮深挖9厘米左右，然后取出冬虫夏草。挖虫草的人们弯腰或者趴在地上仔细观察，沿坡地向上寻找，幸运者可能可挖出20-30根，但也有不少连一根也挖不出来的，每根冬虫夏草真的来之不易。因冬虫夏草分布一般比较集中，在挖出一根冬虫夏草后，其附近可能还有冬虫夏草，在青藏当地人们称为虫草窝子，25天内，会有新的冬虫夏草在此范围生出子座(俗称草头)，日后可留意耐心仔细的寻找，密集处一平方米内可发现冬虫夏草6至22条左右。
刚挖到虫草后，剥开虫草上的泥土，可以看到黄色的虫体，还有白色的粘膜。带土的虫草须用刷子先刷除泥土，再作进一步清洁。清洁后的冬虫夏草，就是传说中的神仙草了，然后就经过各层经销商，被带入市场或加工包装后做成虫草补品。